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本片(剧)是一部美国制片作品的欧美动漫，于2009年上映。对白语言为英语，目前豆瓣评分0.0(仅供参考)。
阿纳金·天行者和他的学徒阿索卡·塔诺，在第二季《克隆人战争》中继续在银河系中穿梭，对抗黑暗势力。当共和国和分离主义之间的冲突愈演愈烈，考验着他们的忠诚度和勇气。
在达索米尔星球上，阿纳金和阿索卡遇到了强大的达索米尔女巫，她们与分离主义结盟。在一次危险的任务中，阿索卡怀疑她的姐妹是否有能力控制黑暗力量，而阿纳金则必须面对他自己的过去与绝地委员会的隔阂。
战争的残暴在整个银河系显现，影响着平民和士兵。当阿纳金和阿索卡前往马里尔营救被困的克隆人部队时，他们目睹了战争的残酷。阿纳金因失去克隆人兄弟而陷入悲痛，而阿索卡则质疑战争的意义。
在其他地方，绝地大师欧比旺·克诺比和绝地议员尤达也在为战争的后果而斗争。欧比旺调查了一起绝地训练生克里克斯·维维恩的死亡事件，发现了一个潜伏在共和国深处的神秘阴谋。尤达则试图通过谈判来结束冲突，但他的努力却遇到了分离主义领袖杜库伯爵的阻挠。
随着战争的不断延续，绝地议会内部的分歧也日益加剧。一些绝地，如梅斯·温杜，主张采取更激进的措施，而另一些，如欧比旺和尤达，则坚持传统的绝地之道。阿纳金发现自己夹在中间，既忠于绝地教义，又渴望采取行动来保护共和国。
在这一季的高潮中，绝地议会发现克隆人部队中存在一个秘密命令，称为“66号令”，该命令一旦执行，将命令克隆人转身对付绝地。阿纳金在得知这一秘密后陷入震惊和困惑，质疑共和国的真实本质和绝地武士团的未来。
在第二季的结尾，阿纳金和阿索卡在曼达洛星球上与死光剑的莫尔对抗，而绝地议会则继续调查克隆人中的黑暗秘密。随着战争的不断升级，阿纳金和阿索卡的命运变得更加不确定，而银河系的未来也悬而未决。